Дом на углу Гоголевского бульвара и Колымажного переулка был построен в 1885 году Елизаветой Михайловной Алексеевой, в девичестве Бостанджогло.
До этого территория на которой был построен особняк входила в состав усадьбы Васильчиковых, главный дом которой сохранился и находится по соседству,
дом 14 на Гоголевском бульваре.
Елизавета Михайловна, после смерти мужа Александра Владимировича Алексеева, разделила усадьбу и для себя построила двухэтажный особняк, а главный дом продала известным меценатам фон Мекк.
Проектировал дом Дмитрий Николаевич Чичагов. Дом отделен от флигеля воротами.
В 1908 году, после смерти Алексеевой, особняк переходит по наследству ее младшей дочери, Елизавете Александровне Руперти.
Ее муж, Эдгар Александрович Руперти, купец 2-й гильдии, директор товарищества «Владимир Алексеев».
После революции 1917 года, а точнее в 1918 году особняк национализировали, а прежних владельцев из него выселили.
19 апреля 1943 года, после реорганизации контрразведки, было создано Главное управление контрразведки СМЕРШ.
Из морского отдела НКВД было сформировано Управление СМЕРШ НК ВМФ, начальником которого был назначен комиссар госбезопасности Петр Андреевич Гладков.
Управление СМЕРШ НК ВМФ разместилось в особняке, на Гоголевском бульваре 16.
В настоящее время в доме располагается финансовое управление МИДа.
